1.專用發(fā)票的使用權(quán)不同。增值稅專用發(fā)票是增值稅一般納稅人銷售貨物或者提供應(yīng)稅勞務(wù)開具的發(fā)票，一般納稅人應(yīng)通過(guò)增值稅防偽稅控系統(tǒng)使用專用發(fā)票。增值稅小規(guī)模納稅人需要開具專用發(fā)票的，可向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申請(qǐng)代開。
2.稅款抵扣的方式不同。一般納稅人可以憑專用發(fā)票等扣稅憑證進(jìn)行進(jìn)項(xiàng)稅額的抵扣，小規(guī)模納稅人由于其征收率已統(tǒng)一考慮了扣稅的因素，因此，不再擁有憑專用發(fā)票扣稅的權(quán)利。
3.應(yīng)納稅額的計(jì)算方法不同。一般納稅人采用由當(dāng)期銷項(xiàng)稅額抵減當(dāng)期進(jìn)項(xiàng)稅額的方法計(jì)算應(yīng)繳稅款，即應(yīng)納稅額=當(dāng)期銷項(xiàng)稅額-當(dāng)期進(jìn)項(xiàng)稅額，而小規(guī)模納稅人實(shí)行簡(jiǎn)易辦法計(jì)算應(yīng)納稅款，即按照銷售額和規(guī)定的征收率計(jì)算應(yīng)納稅額，計(jì)算公式為：應(yīng)納稅額=銷售額×征收率。但符合一般納稅人條件如果不申請(qǐng)辦理一般納稅人認(rèn)定手續(xù)的和會(huì)計(jì)核算不健全，或者未能提供準(zhǔn)確稅務(wù)資料的一般納稅人，應(yīng)按銷售額依照增值稅稅率計(jì)算應(yīng)納稅款，不得抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額，也不得使用增值稅專用發(fā)票，即應(yīng)納稅額=銷售額×增值稅稅率。
4.含稅的銷售額換算公式不同。一般納稅人的含稅銷售額換算成不含稅銷售額，其換算公式為：銷售額=含稅銷售額÷（1+稅率17%或13%）。小規(guī)模納稅人的含稅銷售額換算為不含稅銷售額，換算公式為：銷售額=含稅銷售額÷（1+征收率3%）。
